ケミカル同仁では、受託サービス「Gene Nex」の新サービスとしてワンストップのプロテオミクス解析を開始いたしました。豊富な分析実績をもつ海外ラボでの分析により、リーズナブルな料金で高品質なデータを提供いたします。なお、弊社は理化学機器の代理店として、現在の対面の営業エリアでは引き続きお客様ご指定の分析会社への分析取次ぎも行っております。

[対応アプリケーション]
・定性プロテオミクス
・ラベルフリー定量プロテオミクス
・DIA定量プロテオミクス
・4D定量プロテオミクス(ラベルフリー/DIA)
・Astral定量プロテオミクス(ラベルフリー/DIA)
・TMT定量プロテオミクス
・PRMターゲットプロテオミクス

[使用機器]
・Orbitrap Exploris 480
・Orbitrap Fusion
・Orbitrap Fusion Lumos
・Orbitrap Eclipse
・Orbitrap Astral
・Q Exactive HF
・Bruker timsTOF

[解析内容とデータ例]

(左から)Relative Standard Deviation, Protein Expression Heatmap, KEGG Functional Annotation, COG Functional Annotation

定性プロテオミクス

1. Protein solution/gel: qualitative result table
2. Database Search Results
   2.1 List of peptide segments matched in the database search
   2.2 List of proteins matched in the database search
   2.3 List of modifications matched in the database search (phosphorylation, ubiquitination, etc.)
3. Raw data

定量プロテオミクス(Label-Free/DIA/TMT)

1. Data Preprocessing
   1.1 Protein Database Search
2. Protein Expression Analysis
   2.1 Principal Component Analysis (PCA)
   2.2 Relative Standard Deviation (RSD)
   2.3 K-means Trend Distribution
   2.4 Reproducibility Evaluation
   2.5 Protein Expression Heatmap
3. Functional Annotation
   3.1 GO Functional Annotation
   3.2 KEGG Functional Annotation
   3.3 COG Functional Annotation
   3.4 GOslim Functional Annotation
   3.5 Pfam Protein Structure Domain Annotation
4. Protein Differential Analysis (biological replicates ≥ 3)
   4.1 Protein Differential Analysis Results
   4.2 Distribution of Differential Protein Fold Changes (FC)
   4.3 Statistical Analysis of Differential Protein Quantity
   4.4 Differential Protein Volcano Plot
   4.5 Differential Protein Clustering Heatmap
   4.6 Differential Protein GO Functional Annotation and Enrichment Analysis
   4.7 Differential Protein KEGG Functional Annotation and Enrichment Analysis
   4.8 Differential Protein COG Functional Annotation
   4.9 Differential Protein GOslim Annotation and Enrichment Analysis
   4.10 Differential Protein Structure Domain Annotation and Enrichment Analysis
5. Protein Network Interaction Analysis
6. Protein Reactome Pathway Annotation
7. Signal Peptide Prediction
8. Subcellular Localization of Proteins

定量プロテオミクス (PRM)

1. PRM Protein Quantification Results
   1.1 Overview of Quantification Results
   1.2 Distribution of Fragment Ion Peak Areas for Peptide Segments

[注意事項]
※分析は弊社提携の海外ラボで実施いたします。
※海外ラボでの分析のため、輸送や受け入れができないサンプルもございます。
※ラボ所在国の法令や規制、輸送時や通関検疫時のトラブルなどの不可抗力に起因するサンプルの破損や損失につきましては補償ができかねます。再調製が難しい貴重なサンプルのご提出は十分にご注意ください。
※分析を中止される場合には、輸送費用や作業工程に応じた費用が発生いたします。また、分析結果がお客様の想定と異なりましても弊社では責任を負いかねます。
※分析機器や解析項目は予告なく変更や更新される場合がございます。

リンク先の問い合わせフォームがNGS向けとなっております。お手数ではございますが、備考欄にプロテオミクスとご記入いただき、選択肢は任意のものにチェックをお願いいたします。