既知のゲノム配列がある生物では一塩基多型(SNP)、塩基の挿入や欠失(InDel)、コピー数変異(CNV)、構造多型(SV)などの変異を同定することができます。
生物の進化や多様性の研究だけでなく、作物の品種改良など農業分野での利用にも有益です。レファレンス配列のない生物種については、取得した配列を基にde novoアセンブルも可能です。ロングリードシーケンスのデータと併せてアセンブルをすることで正確性が向上します。
GeneNexのメリット
MERIT-
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01
ワンストップ対応
サンプル調製からバイオインフォマティクスまで同一ラボで実施
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02
優れたデータ品質
illumina社の公式保証値(Q30>75%)を超えるQ30＞80％を保証
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03
スピード納品
ワンストップ対応による速やかな納品を実現
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04
多様なアプリケーション
様々なサンプルやカスタムでのデータ解析にも対応可能
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05
豊富な実績
年間数十万件の分析実績があるベテラン技術チームによる分析
ワークフロー
WORK FLOW
Gene Nexと提携ラボ技術チームが責任を持ち、お客様からお預かりした検体をQCから納品まで取り扱います。
サンプルQC後とデータQC後に結果をまとめたレポートを発行し、内容をご確認いただきます。
データについてのお問い合わせなど、納品後のアフターフォローも丁寧に対応いたします。
- 01 仕様決定とお見積り
- 02 サンプルのお預かり
- 03 サンプルQC
- 04 ライブラリー調製
- 05 ライブラリーQC
- 06 シーケンシング
- 07 データ解析
- 08 データQC
- 09 納品
サンプル要件
SAMPLE REQUIREMENTSサンプル要件
| サンプルの種類 | Genomic DNA |
|---|---|
| DNA量 | ≥200 ng |
| 溶液量 | ≥20 μl |
| 濃度 | ≥10 ng/μl |
| 純度 | OD260/280 = 1.8-2.0 DNAの分解がないこと; コンタミがないこと |
※生体組織から抽出したゲノムDNAでnon-PCR freeライブラリを調製する場合
納期
DELIVERY DATE| 解析なし | 解析あり |
|---|---|
| QC後から 15営業日※1 |
QC後から 30営業日※1 |
- ※サンプルの状態やラボの稼働状況により異なる場合があります。
- ※1…生体組織から抽出したゲノムDNAでnon-PCR freeライブラリの場合
価格
PRICE| 解析なし | 解析あり |
|---|---|
|
50,000 円（税別）※1 |
70,000 円（税別）※2 |
- ※分析仕様やサンプルによって料金が変動しますので詳細はお問い合わせください。
- ※1…non-PCR freeライブラリの場合
- ※2…レファレンスのある生物でSNP/InDel変異解析の場合
仕様
- 350bp insert, non-PCR freeライブラリ
- PE150, 10G base raw data
- ※PCR freeライブラリや配列データのclean data処理などの対応も可能です。
- ※レファレンスのある生物のSNP/InDel/CNV/SV検出やレファレンスのない生物のde novo解析などが可能ですので、詳細はお問い合わせください。
- ※ご希望のデータ量をご指定できます。
ご注文方法
ORDERING METHOD※下図は画面に収まらない場合、左右にスライドしてご覧いただけます。
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お問い合わせ
（お客様） -
見積り
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ご依頼
（お客様） -
サンプル発送
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分析
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納品
｛ 動植物ゲノムシーケンス(WGS）についてお気軽にご相談ください ｝